Родился в 1951 во Львове.
Окончил львовский Институт прикладного и декоративного искусства (1977). В 1980–1981 годах учился в Московском высшем художественно-промышленном училище. С 1984 года – член Московского отделения Союза художников.
В 1984 году Николай Филатов совместно с Андреем Ройтером и Германом Виноградовым создал в расформированном детском саду уникальное художественное явление в московской андеграундной среде – «Детский сад»: сообщество единомышленников и арт-сквот. В этом месте независимые художники могли встречаться, выставлять и хранить свои работы. Просуществовавший до 1986 года «Детский сад» стал легендарной точкой пересечения многих авангардных деятелей того времени. Николай Филатов, стоявший у истоков идеологии движения, следовал идее не выбора верной авангардной траектории в искусстве, а проявления толерантности к любым видам творческой деятельности. В основе движения лежал принцип свободы и плюрализма, допускавшего взаимодействие любых художественных форм и идей. «Детский сад» был живой средой открытого общения. Этот сознательный отказ от поиска наиболее актуальной позиции в искусстве, от следования интеллектуальному мейнстриму свойственен и самому искусству Николая Филатова.